中国人民解放军陆军军医大学博士研究生每生收取学费21000元。学校还开设了研究生奖学金与助学金。具体标准如下：
(一)研究生助学金。
学业助学金：资助对象为所有在校全日制研究生，用于资助研究生进行学位论文相关工作，包括课题研究、学术交流、发表论文、学位论文制作及评阅、答辩等费用，由研究生导师从其科研项目经费中全额支出。
生活助学金：资助对象为在校国家教育部计划全日制地方研究生，用于资助地方研究生的生活补助，资助标准为博士生2000元/人·月，每学年按10个月计发。
(二)研究生新生奖学金。奖励录取为我校全日制研究生的优秀新生。
对录取为生物医学工程、生物学(生理学、微生物学、神经生物学、遗传学、发育生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学)、基础医学、外科学(烧伤、野战外)、药学等基础、军事医学学科专业的教育部计划地方博士生新生，免交学费作为新生奖学金。